Исследователи Университета Арканзаса получили первый высококачественный эталонный геном рисового клопа (Oebalus pugnax), собранный в масштабе хромосом. Работа опубликована в Journal of Heredity. Клопы рода Oebalus наносят серьёзный урон зерновым, в первую очередь рису: питаясь, они нарушают формирование зерна.
Что показал анализ
С помощью современных методов секвенирования учёные реконструировали геном объёмом 826 миллионов пар оснований. В нём идентифицировано свыше 13 000 генов и порядка 21 000 некодирующих РНК.
Отдельно исследователи разобрали ферменты, которые отвечают за переваривание растительной пищи и метаболизм углеводов, а также зафиксировали изменения в семействах генов, связанных с жизненным циклом насекомого. В фокусе оказались и гены, определяющие адаптацию к растениям-хозяевам и устойчивость к инсектицидам.
Зачем это нужно
По словам авторов, понимание генетических особенностей Oebalus pugnax позволит разрабатывать более действенные стратегии защиты рисовых посевов. При этом сама сборка генома — не финальный результат, а ресурс для дальнейших исследований: по мере накопления данных структуру генома будут уточнять и проверять гипотезы об эволюции и поведении вредителя.
В научных подразделениях Всероссийского центра карантина растений (ФГБУ «ВНИИКР» Россельхознадзора) изучают карантинных и других особо опасных насекомых — и как вредителей сельхозкультур, и как переносчиков возбудителей болезней.
Справка: Питание клопов рода Oebalus приводит к появлению на растениях дефектных, пустых, сморщенных или потерявших естественную окраску зёрен, что снижает качество и объём урожая.