Специалисты Нанкинского сельскохозяйственного университета разработали портативную систему, позволяющую выявлять ДНК вируса африканской чумы свиней. Как сообщается в статье, опубликованной в Scientific Reports, на сам анализ уходит порядка 45 минут, не считая времени на отбор пробы.
Как устроен тест
Работа системы построена на двух последовательных реакциях. На первом этапе в пробирке происходит многократное копирование участка ДНК вируса АЧС. Затем реагенты распознают полученные копии — при наличии нужного участка возникает свечение, которое улавливает портативный прибор.
Обе реакции идут в одной пробирке, но изначально разделены перегородкой. После завершения копирования ДНК перегородку прокалывают, и реагенты смешиваются, при этом пробирку не открывают. Такой подход не позволяет компонентам взаимодействовать преждевременно и уменьшает вероятность загрязнения других проб продуктами реакции.
Сигнал фиксирует портативный анализатор, передающий данные на смартфон по Bluetooth.
Цифры испытаний
Подготовка образца занимает примерно пять минут, первый этап исследования — 15 минут, получение флуоресцентного сигнала — ещё 25 минут.
В лабораторных испытаниях тест обнаруживал синтетический фрагмент вирусного гена при концентрации 12,1 копии на микролитр. При проверке на шести других возбудителях болезней свиней, включая вирусы классической чумы, болезни Ауески и репродуктивно-респираторного синдрома, перекрёстных реакций не выявили.
Для проверки на сыворотке исследователи взяли образцы без вируса АЧС и добавили в часть из них лабораторный стандарт с фрагментом его ДНК. Тест выявил все подготовленные таким образом положительные пробы, а образцы без добавленного материала остались отрицательными.
Что предстоит проверить
Авторы отмечают, что полученный предел обнаружения относится к лабораторному стандарту. Образцы от заражённых АЧС свиней в исследовании не использовали. Чтобы оценить точность метода в ветеринарной практике, его ещё предстоит проверить на клиническом материале и сравнить с ПЦР в реальном времени.