Геномная оценка: ясность наступающего завтра

Май 2022 г.
Антон Касков
Фото Татьяны Южаниной

В последние годы в повседневной селекционно-племенной работе сельхозпредприятий всё большее распростра-
нение получает геномная оценка высокопродуктивного скота –оценка по маркерам на основе биологического материала.

        В июле прошлого года гостем одного из вебинаров АНО «Эксперт-Молоко» стал заведующий лабораторией молекулярно-генетической экспертизы АО «Агроплем» Илья Рукин. Запись мероприятия («Геномные технологии
в молочном животноводстве: Зачем нам смотреть в геном?») – в открытом доступе на видеохостинге YouTube: https://www.youtube.com/watch?v=LYSzItLLFgc.
        Сопоставляя существующие геномные технологии, Илья Владимирович охарактеризовал технологию геномной оценки как наиболее современную и эффективную:
        – В середине 50-х годов <ХХ века>... была <внедрена> технология иммунной генетики, которая позволяла кос-
венно подтвердить или опровергнуть, исключить достоверность происхождения <племенного животного>. Эта тех-
нология опосредованно генетическая, то есть она изучает белки молока, которые кодируются, собственно, геномом. <...>
        На замену иммунной генетике в 2000 году пришли микросателлиты и тестирование моногенных заболеваний, то есть уже целевые конкретно-точечные тестирования генома, которые позволяли подтвердить или опровергнуть происхождение, выяснить какие-то аномалии, но это всё еще были точечные тесты. <Однако> технологии не стоят на месте. <...> Технологии генетики... развивались в сторону масштабирования, то есть на сегодняшний день какие-то точечные тестирования в виде микросателлитов или моногенных заболеваний перешли в геномную оценку... это технология, которая, помимо того, что позволяет подтверждать прохождение, она позволяет еще в целом анализи-
ровать геном животного и вычленять из него целый кластер полезной информации.
        Что же такое вообще геномная оценка? Геномная оценка – это технология, которая объединяет в себе три источ-
ника данных – это информация о фенотипах... это данные, которые представляют интерес <для> любого владельца молочного скота... это молочная продуктивность, это фертильность, легкость отелов, то есть те данные, которые либо... приносят деньги, либо... приносят убытки. Также это информация о происхождении животных (родстве)... как... передавался генетический материал из поколения в поколение и к чему приводило это наследование. И, соб-
ственно, информация о генотипе животных – это информация о... ДНК, которая передалась тому животному, кото-
рое мы исследуем... Мы эти... данные... анализируем... и выводим так называемые экономические индексы. То есть мы ранжируем ваших животных с точки зрения... экономической эффективности.

*    *    *

        Подробнее о технологии геномной оценки и спектре задач, которые позволяют решить данные, полученные с ее помощью, нам рассказал Кирилл Кирилл Сикомас, руководитель отдела продаж лаборатории молекулярно-генети-
ческой экспертизы АО «Агроплем»:
        – Действительно, геномная оценка – это инновационный продукт, недавно появившийся на рынке. Его главная ценность состоит в том, что он позволяет заглянуть в геном животного. Согласно расхожему мнению, 70% влияния на продуктивность коровы оказывают внешние факторы: качество корма, сбалансированность рациона, условия содержания, квалифицированность персонала и т.п. А остальные 30% влияния оказывают внутренние, собственно генетические факторы. И если на внешние факторы мы в силах оказать оперативное воздействие – что-то изменить и усовершенствовать, – то генетику животных мы изменить не в силах. Однако мы можем скорректировать влияние генетических факторов, и помощь в этом нам как раз и оказывает геномная оценка. Она позволяет точно опреде-
лить генетический потенциал животного (уровень его продуктивности, качество молока, например, с точки зрения сыропригодности), точно определить племенную ценность (скорректировать родословную, гарантированно избе-
жать инбридинга) и на основании полученных данных ранжировать животных в стаде для максимальной эффек-
тивности их хозяйственного использования. Становится очевидным, каких именно животных и для каких целей следует оставить, а каких животных – продать. Речь, таким образом, идет о селекции совершенно нового качества – геномной селекции.
        Для геномной оценки с уха животного отбирается кожный выщип. Содержащееся в нем ДНК и становится предметом лабораторного исследования. Длится оно недолго: стараемся укладываться в 40 рабочих дней.
        Выщип допустимо делать с первых дней жизни телки, но при наличии проблем с сохранностью молодняка предпочтительнее с 6-месячного возраста, по завершении основной выбраковки. К 8-месячному возрасту племен-
ная ценность животного будет достоверно определена, и у хозяйства остается еще минимум 4 месяца на подбор быка. Один из наших партнеров, напротив, заинтересован в геномной оценке животных более старшего возраста – 2–3-й лактации – для быкопроизводящей группы. По итогам генетической оценки каждому животному присваива-
ется уникальный номер, заносящийся во все международные базы генетических данных.
        В настоящее время у нас уже накоплено достаточное количество генетических и фенотипических (результаты анализа проб контрольных доений) данных КРС для создания собственной достоверной отечественной базы данных. Полагаю, она будет создана до конца 2022 года, в связи с чем постепенно снизится потребность в исполь-
зовании зарубежных аналогов.